Pathobiology Research
Pathobiology Research
mjms
Medical Sciences
http://mjms.modares.ac.ir
1
admin
2538-3000
2538-5887
en
jalali
1393
7
1
gregorian
2014
10
1
17
3
online
1
fulltext
fa
شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی دو ژن شناخته شده (BRCA2 و STK11) عامل سرطان پستان ارثی در یک خانواده ایرانی به روش تعیین توالی اگزوم
Identification of Nucleotide Changes of Two Known Causative Genes (BRCA2 and STK11) of Hereditary Breast Cancer in an Iranian Family using Exome Sequencing
هدف: از زمان شناسایی دو ژن پرنفوذ BRCA1/2 با وراثت بارز در دهه 1990 تاکنون ژن‏های مختلفی شناسایی شده‏است که در مجموع حدود 25 درصد اساس ژنتیکی سرطان پستان ارثی را توضیح می‏دهد و حداقل 75 درصد آن همچنان ناشناخته باقی مانده است. هدف از انجام این مطالعه بررسی وجود یا عدم وجود الگوی وراثتی مغلوب در این بیماری هتروژن است که احتمال وجود آن توسط برخی از محققین مطرح شده است. مواد و روش‏ها: در این مطالعه از روش توالی‏یابی اگزوم که جدیدترین روش مورد استفاده در شناسایی اساس ژنتیکی بیماری‏ها است استفاده شد. همچنین نتایج توالی‏یابی اگزوم با روش توالی‏یابی سنگر تأیید شد. نتایج: در بررسی حاضر هیچ‏گونه جهش هموزیگوتی در خانواده مورد بررسی شناسایی نشد اما یک حذف 4 جفت بازی منجر به جهش تغییر چارچوب به‏صورت هتروزیگوت در اگزون 11 ژن BRCA2 و همچنین یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی هتروزیگوت در اگزون 9 ژن STK11 در خانواده مورد نظر تشخیص داده شد. نتیجه‏گیری: واریاسیون rs80359352 که در این خانواده شناسایی شد یکی از جهش‏های بیماری‏زای شایع در ژن BRCA2 است که در پایگاه اطلاعاتی BIC گزارش شده است و قبلاً در گروه‏های نژادی مختلف از جمله قفقازی، هیسپانیک و چینی مشاهده شده است و از طریق این مطالعه برای اولین بار وجود آن در جمعیت ایرانی و تفکیک آن در سرطان پستان ارثی گزارش می‏شود.
Objective: Since the identification of the two highly penetrant dominantly inherited genes, BRCA1/2, in the 1990s, a number of other genes have been identified which account for approximately 25% of the genetic basis for hereditary breast cancer. At least 75% are unidentified. The goal of this study is to investigate the presence or absence of a recessive pattern of inheritance in this heterogeneous disease whose possibility has been previously discussed by researchers. Methods: In this study we used exome sequencing as the most recent approach for identification of the genetic basis of any disease. The results of exome sequencing were confirmed by Sanger sequencing. Results: Although we did not find any homozygous mutation in this family, however a heterozygous 4bp deletion that led to a frame shift mutation was identified in exon 11 of the BRCA2 gene. Also identified was a heterozygous single nucleotide polymorphism in exon 9 of the STK11 gene. Conclusion: The rs80359352 variation identified in this family is one of the frequent pathogenic mutations in the BRCA2 gene that has been reported in the BIC database. This variation has been previously observed in other ethnic populations such as Caucasians, Hispanics and the Chinese. In this study, for the first time, we report this mutation in Iranian population and its segregation in hereditary breast cancer.
سرطان پستان ارثی,توالییابی اگزوم
BRCA2,rs80359352,STK11,Hereditary breast cancer,Exome sequencing,BRCA2,rs80359352,STK11
81
91
http://mjms.modares.ac.ir/browse.php?a_code=A-30-22036-1&slc_lang=fa&sid=30
Mojgan
Ataei-Kachouei
مژگان
عطایی کچوئی
100319475328460067286
100319475328460067286
No
Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
Javad
Nadaf
جواد
نداف
100319475328460067219
100319475328460067219
No
Department of Human Genetics, McGill University, Montreal, Canada
گروه ژنتیک پزشکی، دانشگاه مک‏گیل، مونترال، کانادا
Mohammad taghi
Akbari
محمد تقی
اکبری
100319475328460067218
100319475328460067218
Yes
Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
Morteza
Atri
مرتضی
عطری
100319475328460067220
100319475328460067220
No
Cancer Research Institute, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مرکز تحقیقات سرطان، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
Jacek
Majewski
جاسک
مجسکی
100319475328460067287
100319475328460067287
No
McGill University and Genome Quebec Innovation Center, Montreal, Canada
مرکز نوآوری دانشگاه مک‏گیل و ژنوم کبک، مونترال، کانادا
Yasser
Riazalhosseini
یاسر
ریاض الحسینی
100319475328460066442
100319475328460066442
No
McGill University and Genome Quebec Innovation Center, Montreal, Canada
مرکز نوآوری دانشگاه مک‏گیل و ژنوم کبک، مونترال، کانادا
Masoud
Garshasbi
مسعود
گرشاسبی
100319475328460067221
100319475328460067221
No
Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران